More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1335 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 149 aa  299  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4579  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1269  universal stress protein  40.97 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4456  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0870  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  34.9 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  32.64 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.76 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  32.21 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  33.77 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3382  UspA domain protein  34.46 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2836  UspA domain protein  30.41 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383702  normal  0.0147976 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.56 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  34.93 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  29.86 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.49 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  31.76 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  28.95 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  30.56 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.25 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  37.32 
 
 		 303 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  32.19 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  30.56 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  30.14 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  29.17 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  37.97 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  31.47 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  29.86 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 449 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  29.53 
 
 		 285 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  25.17 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  25.17 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  25.17 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  25.17 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  25.17 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  25.17 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  27.81 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  25.17 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  29.05 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  29.86 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  29.05 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  25.53 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  27.03 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  25.17 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  33.12 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  32.41 
 
 		 279 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  31.21 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  28.28 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  29.03 
 
 		 180 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  28 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  25.53 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  24.82 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.19 
 
 		 290 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  30.56 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.73 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  26.53 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  30.28 
 
 		 295 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  24.48 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  24.48 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  26.35 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  51.79 
 
 		 280 aa  50.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 565 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  36.17 
 
 		 300 aa  50.1  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  31.33 
 
 		 314 aa  50.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  34.83 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  31.29 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  38.24 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2734  UspA domain protein  33.1 
 
 		 319 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.364646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  25.49 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2411  UspA domain protein  28.17 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000128611  normal  0.369799 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  31.33 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  48.21 
 
 		 297 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  28.28 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  31.51 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  30.77 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  26.8 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  33.75 
 
 		 296 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  31.51 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>