More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3634 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3634  major facilitator transporter  100 
 
 		 565 aa  1092    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.836817  normal  0.0365069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2789  major facilitator superfamily protein MFS_1  64.7 
 
 		 568 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6118  major facilitator superfamily protein MFS_1  59.19 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.27425  normal  0.39659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6077  major facilitator superfamily MFS_1  59.63 
 
 		 407 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4000  major facilitator transporter  59.43 
 
 		 408 aa  375  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2732  major facilitator superfamily protein  54.55 
 
 		 393 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3433  major facilitator transporter  56.16 
 
 		 403 aa  359  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0912154  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3496  major facilitator superfamily transporter  56.16 
 
 		 403 aa  359  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.950594  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3444  major facilitator transporter  55.87 
 
 		 403 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.39865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2728  major facilitator transporter  56.09 
 
 		 404 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.894762 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3781  major facilitator superfamily MFS_1  59.45 
 
 		 407 aa  347  3e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0648  major facilitator superfamily MFS_1  51.98 
 
 		 402 aa  339  5.9999999999999996e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4249  major facilitator superfamily MFS_1  52.3 
 
 		 416 aa  336  7.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.655447 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30430  arabinose efflux permease family protein  50.61 
 
 		 446 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  53.87 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1296  major facilitator transporter  54.87 
 
 		 406 aa  326  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.753687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0401  major facilitator superfamily MFS_1  53.92 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.200396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0045  major facilitator transporter  51.89 
 
 		 417 aa  317  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2998  major facilitator superfamily MFS_1  53.65 
 
 		 412 aa  302  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0156539  decreased coverage  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  51.11 
 
 		 422 aa  297  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01420  arabinose efflux permease family protein  46.43 
 
 		 431 aa  265  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4797  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1563  major facilitator superfamily MFS_1  51.34 
 
 		 424 aa  247  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5165  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1255  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 		 385 aa  241  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5457  putative multidrug resistance protein  39.73 
 
 		 387 aa  239  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5501  multidrug resistance protein, putative  39.73 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5549  putative multidrug resistance protein  39.73 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5493  putative multidrug resistance protein  39.46 
 
 		 387 aa  238  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5220  multidrug resistance protein  39.46 
 
 		 387 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5052  multidrug resistance protein; permease  39.46 
 
 		 387 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5068  multidrug resistance protein; permease  39.46 
 
 		 387 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5620  multidrug resistance protein  39.46 
 
 		 387 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5463  putative multidrug resistance protein  39.46 
 
 		 387 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3885  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2203  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 368 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2675  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.429667  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2349  multidrug resistance protein  28.04 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.306519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1474  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 		 510 aa  67  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.942704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1797  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.17 
 
 		 503 aa  66.6  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1984  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.04 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.241117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1151  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  26.6 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.22 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.84 
 
 		 511 aa  64.7  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0865  multidrug resistance protein B  26.6 
 
 		 526 aa  63.9  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.25 
 
 		 508 aa  63.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1919  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0639753  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.22 
 
 		 508 aa  62.8  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 526 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0515  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.66 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.19 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.83 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.5 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  28.22 
 
 		 528 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.93 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.13 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3103  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.04 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0196822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.42 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.07 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1858  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.136478  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.95 
 
 		 509 aa  57  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.67 
 
 		 512 aa  57  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.85 
 
 		 513 aa  57  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.49 
 
 		 491 aa  57  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7638  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.48 
 
 		 501 aa  56.6  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.41 
 
 		 613 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 406 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.41 
 
 		 538 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.58 
 
 		 525 aa  55.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3908  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4370  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 462 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.56 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.67 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000901  inner membrane component of tripartite multidrug resistance system  27.33 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.69 
 
 		 529 aa  55.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3018  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.48 
 
 		 532 aa  55.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0924921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 463 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0027  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 481 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3371  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 513 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.26 
 
 		 518 aa  54.7  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0683738  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  26.71 
 
 		 524 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3066  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 473 aa  54.7  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.17 
 
 		 440 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  26.71 
 
 		 400 aa  54.7  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 398 aa  54.3  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2690  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 		 519 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  0.47793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 		 462 aa  54.3  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.711123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0921  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 455 aa  54.3  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224208  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 		 523 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.16 
 
 		 512 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0486  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.38 
 
 		 520 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5834  normal  0.0840581 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 421 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4904  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.9 
 
 		 529 aa  53.9  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.04 
 
 		 501 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3552  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 511 aa  53.5  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>