105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2836 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2836  UspA domain protein  100 
 
 		 152 aa  310  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383702  normal  0.0147976 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  42.38 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3382  UspA domain protein  44.37 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  40.79 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4579  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0870  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1269  universal stress protein  31.69 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4456  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 		 317 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  30.41 
 
 		 317 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  27.21 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  33.08 
 
 		 317 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  30.26 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  27.89 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  29.68 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  27.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  26.8 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  30.26 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  28.38 
 
 		 135 aa  48.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0233  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  28.19 
 
 		 315 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  26 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  31.54 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  24.52 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  27.52 
 
 		 319 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  31.07 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  28.19 
 
 		 315 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  28.77 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  29.53 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  27.52 
 
 		 315 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1585  UspA domain protein  28.1 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0149125 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  31.33 
 
 		 305 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  25.85 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4276  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  25 
 
 		 287 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  25.85 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  27.74 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2826  hypothetical protein  25.85 
 
 		 145 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0301655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  25.85 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  25.85 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  25.85 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  25.85 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  28.38 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  25.85 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  26.58 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  25.85 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30.43 
 
 		 283 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2335  universal stress protein  29.86 
 
 		 147 aa  43.9  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  25.17 
 
 		 154 aa  43.9  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0090  UspA domain protein  28.57 
 
 		 137 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  25.85 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  25.34 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  30.67 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  26.38 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  29.79 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  29.79 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  30.22 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0087  UspA domain protein  28.57 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.270919 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  24.49 
 
 		 287 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  24.49 
 
 		 296 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  28.57 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  29.73 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  25.68 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  25.34 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0489  hypothetical protein  24.67 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  25.68 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  33.06 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  28.1 
 
 		 155 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28.85 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  28.37 
 
 		 301 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.14 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  25.33 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.89 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2401  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.499037 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  28.87 
 
 		 295 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  27.59 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.87 
 
 		 304 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0959  UspA domain protein  28.08 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0112634  normal  0.295172 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  29.79 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>