118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1269 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1269  universal stress protein  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4456  UspA domain-containing protein  92.57 
 
 		 181 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4579  UspA domain-containing protein  89.86 
 
 		 149 aa  270  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0870  UspA domain-containing protein  83.11 
 
 		 148 aa  250  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  39.01 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  40.43 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  36.55 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2836  UspA domain protein  31.69 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383702  normal  0.0147976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3382  UspA domain protein  37.93 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  34.23 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  30.34 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  26.77 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.59 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  27.03 
 
 		 144 aa  52.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  28.77 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.86 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  24.31 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  27.83 
 
 		 165 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 144 aa  50.8  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  27.83 
 
 		 165 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  27.97 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  27.97 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  27.97 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  27.97 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  27.97 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  27.83 
 
 		 165 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  27.83 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  27.97 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  27.83 
 
 		 163 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  27.97 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  29.52 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30.82 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  25.87 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  36.71 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  24.82 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  35.44 
 
 		 280 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0404  UspA domain protein  27.7 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  32.91 
 
 		 300 aa  47.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  30.28 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  26.81 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  26.76 
 
 		 164 aa  47  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  25.53 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  34.34 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  29.45 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  30.61 
 
 		 295 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  34.74 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.66 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  26.96 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  32.65 
 
 		 300 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  27.7 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  30.49 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  26.96 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.78 
 
 		 290 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  28.28 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  36.27 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.78 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.18 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  40.38 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  26.21 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  23.97 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  28.87 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  21.28 
 
 		 143 aa  42.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  26.85 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4718  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.811559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.67 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  24.65 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  28.97 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  32.47 
 
 		 166 aa  42.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  28.86 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  25.71 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  29.13 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31032  predicted protein  25.41 
 
 		 274 aa  42  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00513436  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  24.83 
 
 		 152 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  25.61 
 
 		 164 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01240  universal stress protein UspA-like protein  36.23 
 
 		 144 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  27.08 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0620  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  21.99 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  36.9 
 
 		 287 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  34.38 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  25.89 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  26.21 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  32 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  24.5 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  24.84 
 
 		 187 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>