94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4456 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4456  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  361  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38489  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1269  universal stress protein  92.57 
 
 		 148 aa  278  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4579  UspA domain-containing protein  89.86 
 
 		 149 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0870  UspA domain-containing protein  84.46 
 
 		 148 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27450  hypothetical protein  38.62 
 
 		 148 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0135503  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2836  UspA domain protein  31.51 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383702  normal  0.0147976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3382  UspA domain protein  39.31 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.595815  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2322  hypothetical protein  36.55 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.566925  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  32.41 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  34.9 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  28.28 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  26.17 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  26.17 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  26.24 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  30 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  25.98 
 
 		 120 aa  51.2  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  31.86 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  28.77 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  29.41 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  29.41 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  29.41 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  29.41 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  29.41 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  31.69 
 
 		 150 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  29.41 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0404  UspA domain protein  28.86 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  29.13 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  29.41 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  33.33 
 
 		 295 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.51 
 
 		 303 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  35.44 
 
 		 280 aa  46.6  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  28.57 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  41.27 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  25.17 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  34.69 
 
 		 300 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  29.73 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  35.05 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  25.17 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  28.57 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  35.44 
 
 		 137 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 137 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1934  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  28.57 
 
 		 154 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  29.45 
 
 		 148 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  35.23 
 
 		 143 aa  44.7  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6378  UspA domain protein  25.53 
 
 		 144 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.17 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3227  hypothetical protein  29.21 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0705229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.78 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  28.47 
 
 		 306 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  33.33 
 
 		 130 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  30.84 
 
 		 296 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  29.73 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.65 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  25.61 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  31.58 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  19.44 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  34.25 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 128 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.18 
 
 		 137 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  27.73 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  27.27 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  22.7 
 
 		 130 aa  42  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.88 
 
 		 290 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.89 
 
 		 288 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  25 
 
 		 164 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  41.07 
 
 		 148 aa  42  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 137 aa  42  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  27.7 
 
 		 309 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  28.97 
 
 		 147 aa  42  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  28.86 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  30.67 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  28.06 
 
 		 141 aa  41.6  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  24 
 
 		 156 aa  41.2  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  28.86 
 
 		 297 aa  41.2  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2749  hypothetical protein  23.29 
 
 		 145 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.710836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 138 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 291 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  23.81 
 
 		 150 aa  41.2  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  26.17 
 
 		 303 aa  40.8  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  31.65 
 
 		 297 aa  40.8  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>