More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_05020  universal stress protein UspA-like protein  100 
 
 		 293 aa  562  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.24 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  36.64 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  37.28 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  36.36 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  36.39 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  34.19 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 		 292 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 		 292 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 293 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  34.8 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.33 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.07 
 
 		 288 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  35.83 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  43.09 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.33 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  35.5 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  35.5 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  34.71 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.31 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  35.64 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  32.42 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  35.59 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  32.99 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  34.86 
 
 		 301 aa  99.4  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  34.51 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  31.94 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  33.7 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  33.33 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  32.06 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  35.35 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  33.66 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  35.31 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  34.52 
 
 		 283 aa  95.9  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  32.54 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  32.54 
 
 		 294 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  32.87 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  32.55 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  34.92 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  32.64 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  36.46 
 
 		 292 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  32.98 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  32.98 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  34.58 
 
 		 310 aa  92.4  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  33.45 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  31.35 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  35.99 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  28.21 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  35.64 
 
 		 275 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  34.24 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  30.69 
 
 		 304 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 295 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  36.52 
 
 		 299 aa  86.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  35.27 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  31.03 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 341 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  41.04 
 
 		 147 aa  85.9  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  33.33 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  35.67 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.31 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.31 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  33 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  28.04 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  31.93 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  33.67 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  29.37 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  34.24 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  33.79 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  34.08 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  34.97 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  37.58 
 
 		 155 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  33.87 
 
 		 321 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  34.46 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  31.03 
 
 		 287 aa  80.5  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  32.52 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  32.15 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  40.15 
 
 		 147 aa  78.2  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  30.14 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  30.51 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2069  UspA domain protein  33.92 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000374133 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  26.78 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  29.86 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1005  UspA domain-containing protein  32.75 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.137418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  32.4 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  29.33 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  30.3 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>