More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3498 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  310  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2106  UspA domain protein  43.75 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2112  UspA domain protein  43.12 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.73 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.34 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.34 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  31.03 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  32.87 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.21 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  26 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  26.9 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.08 
 
 		 320 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6968  UspA domain protein  30.82 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483791  normal  0.0402006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  31.51 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  26.21 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  25.35 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  26.43 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.8 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  25.97 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  25.68 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  27.52 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  31.08 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.08 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  28.08 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.71 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0874  UspA domain-containing protein  25.19 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3148  UspA domain-containing protein  25.19 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3249  UspA domain-containing protein  25.19 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  27.33 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  24.82 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3681  universal stress protein  24.44 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1009  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1030  UspA domain protein  25.93 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.374464 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  27.97 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  27.08 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  27.33 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  27.08 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  25.32 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  32.43 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  27.15 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  25.53 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  23.24 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  31.01 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  22.37 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  27.78 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1042  UspA domain-containing protein  25.19 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.49662 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3330  UspA domain-containing protein  25.19 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.67 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  26.95 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  29.55 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.73 
 
 		 290 aa  57  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  25.53 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  28.79 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1569  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  27.78 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  28.28 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  28.57 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  24.34 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3713  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  29.14 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3100  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  25.52 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  24.5 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  22.15 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25.5 
 
 		 288 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  27.5 
 
 		 278 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  30.2 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2853  hypothetical protein  24.82 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.036432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  27.1 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  29.33 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  23.13 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  29.25 
 
 		 280 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  26.17 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  29.53 
 
 		 310 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  29.25 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2111  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000930123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>