More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1666 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1666  UspA domain protein  100 
 
 		 172 aa  332  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.189674  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  43.62 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  40.41 
 
 		 287 aa  90.9  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  36.69 
 
 		 288 aa  84.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.57 
 
 		 155 aa  84.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  42.47 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  37.41 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  36.62 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  36.14 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  35.66 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.24 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  37.2 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  36.96 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  34.53 
 
 		 300 aa  77.8  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.23 
 
 		 290 aa  77.8  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  35.76 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  36.05 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.38 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.04 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.3 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  38.62 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  40.58 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  37.24 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  37.41 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  37.41 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  38.19 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  38.3 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  35.14 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  33.33 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  34.72 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  36.49 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  33.09 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  31.25 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  35.62 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.46 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  32.89 
 
 		 301 aa  65.1  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  34.75 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  33.56 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  32.93 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  31.47 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  35.37 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  30.61 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  29.93 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.03 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  31.71 
 
 		 287 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  31.69 
 
 		 146 aa  62  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  29.93 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  33.78 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  32.14 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  33.57 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  43.28 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  32.93 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  30.61 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  31.33 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  28.22 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  31.91 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  31.91 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  40.91 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  33.77 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  31.97 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.77 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  36.29 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  32.86 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  28.87 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  29.45 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.15 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  32.62 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.86 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  37.33 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  33.93 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.25 
 
 		 149 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  29.14 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  26.85 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.17 
 
 		 320 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  27.91 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  33.59 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  29.08 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  38.64 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.11 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  38.64 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  34.06 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.29 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  34.46 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  30 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  28.37 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  31.47 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  30.66 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  34.46 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0966  UspA domain protein  30.61 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  28.87 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 297 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>