More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2164 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  100 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  65.97 
 
 		 153 aa  187  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  65.97 
 
 		 156 aa  186  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  59.72 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  57.64 
 
 		 151 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  40.56 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  43.36 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  43.15 
 
 		 152 aa  103  7e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  37.16 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  42.21 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  44.22 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  37.5 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  39.73 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  42.36 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  37.24 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  37.76 
 
 		 147 aa  96.3  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  42.47 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  45.07 
 
 		 307 aa  96.3  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  42.47 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.99 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  42.21 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  41.06 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  41.55 
 
 		 159 aa  94  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 145 aa  94.4  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  40 
 
 		 148 aa  94  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  40.85 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  36.99 
 
 		 148 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  42.18 
 
 		 415 aa  92.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  41.5 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  38.85 
 
 		 207 aa  91.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  40.85 
 
 		 300 aa  90.9  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  38.51 
 
 		 288 aa  90.5  7e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  38.78 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  40.14 
 
 		 208 aa  90.5  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.99 
 
 		 157 aa  89.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  39.74 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  32.88 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.48 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  38.26 
 
 		 290 aa  88.2  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  37.34 
 
 		 161 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  42.95 
 
 		 280 aa  87  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  36.91 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  36.99 
 
 		 144 aa  86.3  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.91 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  38.41 
 
 		 301 aa  84.7  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.17 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  38.73 
 
 		 297 aa  84.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  37.06 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  40.14 
 
 		 294 aa  83.6  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1888  putative universal stress protein  38.96 
 
 		 184 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.803254  normal  0.974311 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  32.65 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  36.62 
 
 		 301 aa  81.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2586  universal stress protein  35.25 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0483395  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  39.07 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  37.76 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  36.55 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  35.42 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  38.26 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  35.21 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  36.13 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  37.75 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  38.71 
 
 		 286 aa  77.8  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  31.94 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  34.64 
 
 		 295 aa  77.8  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  37.58 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.62 
 
 		 305 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  31.69 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  34.81 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  36.3 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  35.1 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2183  hypothetical protein  31.79 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  33.57 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  38.3 
 
 		 283 aa  74.3  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.78 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  34.72 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  35.66 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1409  UspA domain protein  40.34 
 
 		 118 aa  73.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.379594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  35.57 
 
 		 165 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>