172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1583 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1583  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 274 aa  537  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.932581  normal  0.58518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1534  UspA domain-containing protein  78.1 
 
 		 274 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  34.47 
 
 		 294 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  35.74 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  33.95 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1901  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 295 aa  93.2  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184723  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  33.46 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  34.8 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  30.21 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  31.88 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  30.41 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  29.54 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  30.43 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  31.95 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  30.68 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  30.8 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  30.25 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  31.32 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  31.32 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  31.32 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  29.12 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 298 aa  75.5  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  33.21 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  29.74 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  28.9 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  33.49 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  32.54 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  29.07 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  29.18 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.96 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  29.35 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  28.43 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  31.12 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.63 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  28.14 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  31.91 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  33.8 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  28.72 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  28.46 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  28.46 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  30.08 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  32.3 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  32.03 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  30.48 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  30.34 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  28.38 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  28.62 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  37.59 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  29.41 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  31.86 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  28.43 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  29.82 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  29.57 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  31.29 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2760  hypothetical protein  30.93 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  33.21 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  30.74 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  27 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  28.16 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  31.3 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1806  UspA domain protein  32.16 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0998568  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  28.42 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  30.54 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  30.24 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  31.05 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3905  UspA domain protein  37.5 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166049  normal  0.0332237 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  29.07 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  30.53 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  30.53 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  28.23 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  28.77 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2773  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  37.5 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  30.04 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  29.64 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  27.84 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  32.56 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  28.04 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  29.78 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  33.81 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  30.53 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  30.43 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  32.53 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  27.66 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2802  UspA domain protein  34.48 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  31.54 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  36.42 
 
 		 293 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>