148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0179 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  44.76 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  45.77 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  49.3 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  49.3 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  45.39 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  49.3 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  44.68 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  44.37 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  38.46 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  38.03 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  36.81 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  37.76 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  33.8 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  33.8 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  35.92 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  38.62 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  37.06 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  35.86 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  34.03 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  34.04 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  31.91 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  32.39 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  30.77 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  34.01 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  34.01 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  34.01 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  34.01 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  34.01 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  34.69 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  34.69 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  34.69 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  34.69 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  34.01 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  34.01 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  34.01 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  34.01 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.9 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  31.91 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  31.29 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  31.29 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  31.29 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  29.73 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  31.29 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  31.29 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  31.29 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  31.29 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  30.61 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  29.25 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  28.87 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2171  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.981815  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  32.19 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  30.97 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  29.66 
 
 		 143 aa  50.1  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  30.5 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  31.29 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  29.66 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  27.46 
 
 		 207 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  26.21 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  28.17 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  34.03 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1352  hypothetical protein  42.42 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.486756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.28 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3749  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 281 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.074776  hitchhiker  0.000110577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0866  UspA domain protein  29.17 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0647651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.4 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.19 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  29.53 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.57 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  28.67 
 
 		 305 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  25.34 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.9 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  32 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  30.34 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  29.05 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  27.81 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  28.17 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  32.06 
 
 		 166 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.95 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0994  UspA domain protein  30.56 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6366  UspA domain protein  29.86 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890005  normal  0.312841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  25.79 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>