87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6366 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6366  UspA domain protein  100 
 
 
155 aa  309  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890005  normal  0.312841 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6187  UspA domain protein  80.65 
 
 
155 aa  254  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751089  normal  0.351957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0866  UspA domain protein  43.8 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0647651  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0994  UspA domain protein  40.88 
 
 
139 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  38.97 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  31.88 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  30.56 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  30.56 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  30.56 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  30.56 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  30.56 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  28.47 
 
 
143 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  30.71 
 
 
141 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  29.17 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  29.17 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  29.17 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  29.17 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  29.86 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  30.71 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  28.47 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  28.47 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  28.67 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  28.47 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  29.17 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  28.47 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  28.47 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  30.71 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  28.67 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  28.67 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  28.67 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  28.67 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  30 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  30.71 
 
 
143 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  29.29 
 
 
141 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  27.97 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  27.97 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  27.97 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  28.47 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  28.57 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  30.34 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  27.78 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  28.28 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  28.33 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  24.31 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  31.93 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  30.66 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.11 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  29.86 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  28.47 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.09 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  26.95 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  29.86 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  31.97 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  24.82 
 
 
147 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  24.82 
 
 
147 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  31.11 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  31.82 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3106  UspA domain-containing protein  27.85 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  27.93 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  32.06 
 
 
863 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  27.93 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  25.56 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  24.11 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  25.36 
 
 
144 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  25.53 
 
 
144 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  25.68 
 
 
143 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  24.11 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  25.71 
 
 
141 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  39.24 
 
 
157 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1352  hypothetical protein  30.94 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.486756  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 
142 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  30 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  24.09 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  28.26 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  39.13 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  27.12 
 
 
250 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  28.07 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  26.76 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 
153 aa  40.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  25.81 
 
 
515 aa  40.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>