271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0994 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0994  UspA domain protein  100 
 
 		 139 aa  274  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0866  UspA domain protein  86.33 
 
 		 139 aa  249  8.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0647651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  59.56 
 
 		 136 aa  167  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  47.14 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6187  UspA domain protein  42.34 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751089  normal  0.351957 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6366  UspA domain protein  40.88 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890005  normal  0.312841 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  35.97 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  40.15 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  34.75 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  33.57 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  31.97 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  31.97 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  31.97 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  31.97 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  31.97 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  31.21 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  31.29 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  31.29 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  31.29 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  31.29 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  31.08 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  31.08 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  31.08 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1352  hypothetical protein  36.11 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.486756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  31.08 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  31.43 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  30.71 
 
 		 143 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  34.27 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  31.94 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  30.71 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  36.52 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  33.33 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  32.64 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  31.03 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  30.61 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  30.28 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  34.78 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  29.45 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  34.03 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  36 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  26.06 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  26.06 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  44.83 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  31.34 
 
 		 282 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  44.83 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  26.06 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  26.06 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  45.9 
 
 		 280 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  26.06 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  36.79 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  26.06 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  26.06 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  26.75 
 
 		 177 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  29.25 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  29.25 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  28.28 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  32.45 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  30.17 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  29.37 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  28.08 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  30.09 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  36.59 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  32.43 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  27.97 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  29.66 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2117  universal stress protein family protein  29.58 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  36.89 
 
 		 301 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  27.2 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  29.2 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  28.67 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3344  hypothetical protein  29.03 
 
 		 307 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  28.77 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 289 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  30.25 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.08 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  27.97 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  28.17 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  35.45 
 
 		 286 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  34.15 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  35.45 
 
 		 286 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  33.7 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0206  universal stress protein A  28.87 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  36.92 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4186  UspA domain protein  30.11 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  29.17 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4225  UspA domain protein  30.11 
 
 		 182 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109852  normal  0.228049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>