95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6187 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6187  UspA domain protein  100 
 
 		 155 aa  309  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.751089  normal  0.351957 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6366  UspA domain protein  80.65 
 
 		 155 aa  254  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890005  normal  0.312841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0866  UspA domain protein  44.53 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0647651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0994  UspA domain protein  42.34 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  37.5 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  31.16 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  29.17 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  31.25 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  39.08 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  30 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  32.14 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  31.91 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  29.25 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  29.25 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  29.25 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  29.25 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  29.25 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.64 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  30 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1352  hypothetical protein  30.83 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.486756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  29.29 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  35.56 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  27.54 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  27.66 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  28.28 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  28.57 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  28.57 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  28.57 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  29.29 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  28.57 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  34.31 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  28.93 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  25 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  26.28 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  27.89 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  31.82 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  27.89 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  34.69 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  27.89 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  26.39 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  31.09 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  26.43 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  23.08 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  26.43 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  27.89 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  35.63 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  27.89 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  26.06 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  26.06 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  26.06 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  28.47 
 
 		 143 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  26.06 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  26.06 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.07 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  31.4 
 
 		 151 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  33.65 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 250 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  28.24 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  27.89 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  24.83 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  25.35 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  25.35 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  25.35 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  26.21 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  31.43 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  25.17 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  30.77 
 
 		 164 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  30.77 
 
 		 164 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  41.3 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.82 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  22.14 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  27.7 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  40.98 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  34.67 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  26.35 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  28.06 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  29.17 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  30 
 
 		 863 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  31.75 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0547  UspA domain protein  32.52 
 
 		 253 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  27.7 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  39.13 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>