98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2734 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  100 
 
 		 141 aa  286  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  37.14 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  36.43 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  36.43 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  36.43 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  36.43 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  36.43 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  36.43 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  36.43 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  32.14 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  34.78 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  33.09 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  33.09 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  35.46 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  35.46 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  35.46 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  35.46 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  35.46 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  36.43 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  34.46 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  33.33 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  35.46 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  33.1 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  33.56 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  34.27 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  34.27 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  34.27 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  34.27 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  34.27 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  34.27 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  34.27 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  34.27 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  33.57 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  35.66 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  39.24 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1352  hypothetical protein  31.97 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.486756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  50.91 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  49.23 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  52.73 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  31.91 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  32.37 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  50.91 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0071  hypothetical protein  30.36 
 
 		 308 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.677177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0994  UspA domain protein  30.28 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0866  UspA domain protein  27.4 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0647651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2040  putative universal stress protein  30.28 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.190459  normal  0.175544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0772  universal stress protein G  37.04 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0667  universal stress protein G  37.04 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0726  universal stress protein G  37.04 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0712  universal stress protein G  37.04 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.9695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0653  universal stress protein G  37.04 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  34.52 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2213  putative UspA domain protein  25.53 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1250  hypothetical protein  35.14 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  29.49 
 
 		 314 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  29.58 
 
 		 217 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  41.67 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  45.76 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  28.92 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2686  universal stress protein  27.14 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0810478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  27.33 
 
 		 145 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30.43 
 
 		 149 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  38.89 
 
 		 151 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6366  UspA domain protein  25.71 
 
 		 155 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0890005  normal  0.312841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  37.74 
 
 		 120 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  41.07 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  37.1 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  38.89 
 
 		 320 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  37.29 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  35.9 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 323 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  35.85 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  38.89 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  45.28 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  40.74 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.43 
 
 		 304 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.52 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  40.74 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  35.71 
 
 		 300 aa  40.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  35.19 
 
 		 151 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  27.54 
 
 		 415 aa  40  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>