110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0772 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0667  universal stress protein G  100 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0726  universal stress protein G  100 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.678292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0772  universal stress protein G  100 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0653  universal stress protein G  100 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0712  universal stress protein G  100 
 
 		 97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.9695 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0628  universal stress protein G  87.63 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0659  universal stress protein G  87.63 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0628  universal stress protein G  87.63 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0521  universal stress protein G  87.63 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0693  universal stress protein G  87.63 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.727878  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00576  universal stress protein UP12  86.6 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3017  UspA domain protein  86.6 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3036  UspA domain-containing protein  86.6 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00565  hypothetical protein  86.6 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1147  UspA domain-containing protein  85.57 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.280901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1937  UspA domain-containing protein  49.47 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2566  UspA domain-containing protein  42.39 
 
 		 143 aa  87  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.31142  normal  0.160987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2836  UspA domain protein  42.11 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2532  UspA domain protein  42.11 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1771  universal stress protein F  46.99 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0837729 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1834  universal stress protein F  46.99 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1773  universal stress protein F  46.99 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.633651  normal  0.0944552 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1502  universal stress protein F  46.99 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.432099  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1685  universal stress protein F  46.99 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0435547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2676  UspA domain protein  41.24 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1834  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.52305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4244  UspA domain-containing protein  44.05 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1232  UspA domain protein  40.21 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1559  universal stress protein F  40.22 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1777  universal stress protein F  39.13 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1613  universal stress protein F  39.13 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1994  universal stress protein F  39.13 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01347  stress-induced protein, ATP-binding protein  39.13 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2270  UspA domain protein  39.13 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397995  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1462  universal stress protein F  39.13 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.694319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2280  UspA domain-containing protein  39.13 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01359  hypothetical protein  39.13 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  37.65 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1477  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41182  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3824  hypothetical protein  37.21 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1660  hypothetical protein  37.65 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113526  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1445  UspA domain protein  37.65 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228504  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2329  hypothetical protein  39.53 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0031  UspA domain protein  39.74 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.781417  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2734  universal stress protein  37.04 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5541  putative universal stress protein (Usp)  35.29 
 
 		 141 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201393 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  31.4 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3686  hypothetical protein  35.29 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.460591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4462  UspA domain protein  34.12 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.60022  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  32.56 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  29.07 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0501  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 283 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3802  hypothetical protein  33.71 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.356211  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3481  UspA domain-containing protein  33.71 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  27.78 
 
 		 310 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  27.78 
 
 		 310 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  27.78 
 
 		 310 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  27.78 
 
 		 310 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  30.21 
 
 		 282 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  31.4 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  50 
 
 		 303 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  26.67 
 
 		 310 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  37.35 
 
 		 217 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  42.37 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  43.33 
 
 		 314 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  43.86 
 
 		 300 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  29.73 
 
 		 306 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  42.37 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3093  UspA domain-containing protein  34.88 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0700  hypothetical protein  30.38 
 
 		 306 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00113643  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0609  hypothetical protein  37.29 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0479495  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0603  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.784504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  36.07 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1265  hypothetical protein  34.62 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  43.33 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  29.21 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  31.82 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0473  hypothetical protein  30.38 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.203309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  47.17 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0071  hypothetical protein  28.74 
 
 		 308 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.677177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0179  hypothetical protein  39.06 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.019159  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  25.56 
 
 		 310 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  25.56 
 
 		 310 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  25.56 
 
 		 310 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  25.56 
 
 		 310 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  43.33 
 
 		 297 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2094  hypothetical protein  34.15 
 
 		 140 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30 
 
 		 146 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  43.33 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.07 
 
 		 153 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  42.31 
 
 		 150 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0018  UspA domain protein  33.73 
 
 		 162 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.317282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  47.06 
 
 		 166 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  37.5 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  33.68 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  27.06 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  37.5 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2454  UspA domain protein  33.33 
 
 		 283 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>