221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3263 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3263  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  571  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3749  UspA domain-containing protein  85.77 
 
 		 281 aa  504  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.074776  hitchhiker  0.000110577 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  29.1 
 
 		 415 aa  68.9  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  28.67 
 
 		 159 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.38 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  30 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.41 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  27.08 
 
 		 145 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  28.97 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  29.71 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.76 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  25.86 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  31.25 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.57 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  27.51 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.46 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28.28 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  29.89 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.55 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  29.08 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  28.57 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 137 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  26.39 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  30.56 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  27.08 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 297 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  30 
 
 		 133 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.37 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.49 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  23.94 
 
 		 147 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  30.46 
 
 		 148 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  29.45 
 
 		 146 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  25.71 
 
 		 208 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.64 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  32.64 
 
 		 144 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  26.77 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  29.17 
 
 		 140 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  29.17 
 
 		 145 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  30.2 
 
 		 143 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  25.87 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  27.33 
 
 		 146 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 171 aa  52.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  28.77 
 
 		 301 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  24.14 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 151 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 144 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  25.79 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 		 145 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  33.1 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  33.7 
 
 		 108 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  23.65 
 
 		 140 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  28.67 
 
 		 154 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  27.87 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.07 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  23.97 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  27.5 
 
 		 295 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  26.71 
 
 		 145 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 142 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  28.76 
 
 		 147 aa  50.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  20.29 
 
 		 165 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  25.87 
 
 		 150 aa  50.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  30.94 
 
 		 141 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  27.4 
 
 		 145 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  22.38 
 
 		 150 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 147 aa  50.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  22.3 
 
 		 139 aa  49.7  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  26.04 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 		 145 aa  49.7  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  23.33 
 
 		 148 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  28.19 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.22 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  23.61 
 
 		 145 aa  49.3  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  23.61 
 
 		 140 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  26.39 
 
 		 156 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  30.61 
 
 		 146 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  23.39 
 
 		 130 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  27.52 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  28.77 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  23.4 
 
 		 142 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  24.48 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 162 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  31.29 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  23.65 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  28.37 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  31.29 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  31.29 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  31.29 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  31.29 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  26.71 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  23.65 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>