167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2877 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  100 
 
 
300 aa  586  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  99 
 
 
300 aa  580  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  41.58 
 
 
352 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  32.99 
 
 
298 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  30.61 
 
 
309 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
291 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
291 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  27.67 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  26.43 
 
 
297 aa  86.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  28.97 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  31.1 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  30.53 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  30.53 
 
 
286 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  29.9 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.73 
 
 
314 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  24.91 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  26.76 
 
 
297 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  28.42 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  32 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  30.13 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  27.53 
 
 
289 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  27.17 
 
 
288 aa  62.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  31.25 
 
 
309 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  27.93 
 
 
293 aa  62.4  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  23.93 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  28.24 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  27.21 
 
 
295 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.04 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  30.28 
 
 
309 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  32.31 
 
 
282 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  28.71 
 
 
303 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.69 
 
 
297 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  27.93 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  25.9 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  27.24 
 
 
282 aa  57  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  30.05 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  25.53 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  29.03 
 
 
265 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  21.71 
 
 
320 aa  56.2  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.01 
 
 
320 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  19.73 
 
 
283 aa  55.8  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  27.09 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 
297 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  27.5 
 
 
285 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  22.5 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  29.56 
 
 
271 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  26.96 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.31 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  30.64 
 
 
289 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  29.69 
 
 
297 aa  53.1  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  28.38 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  27.01 
 
 
305 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 
276 aa  52  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  26.9 
 
 
149 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  27.64 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.68 
 
 
159 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  23.51 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1338  UspA domain protein  27.89 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0244136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  31.28 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.46 
 
 
149 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  27.21 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
149 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  27.17 
 
 
282 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2980  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
143 aa  50.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1031  UspA domain protein  27.4 
 
 
145 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.365908 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 
308 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1043  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
150 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.49282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3329  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
150 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1010  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 
150 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  30.81 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  29.32 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  28.44 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  30.81 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  23.08 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  30.81 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  21.36 
 
 
320 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  19.22 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  23.72 
 
 
310 aa  48.5  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2862  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 
147 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  24 
 
 
157 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.69 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  26.06 
 
 
147 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  30.5 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25.69 
 
 
288 aa  47.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  25.6 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
289 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  32.47 
 
 
156 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2459  UspA domain protein  31.65 
 
 
272 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.564309  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  31.68 
 
 
296 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 
143 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  30.67 
 
 
297 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  26.4 
 
 
290 aa  47  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 
300 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  32.58 
 
 
324 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  25 
 
 
143 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  24.9 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 
149 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22870  universal stress protein UspA-like protein  31.91 
 
 
149 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.354321 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>