More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2660 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  36.12 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  36.56 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  36.3 
 
 
297 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  33.22 
 
 
285 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 
289 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  32.24 
 
 
282 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  32.08 
 
 
297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 
306 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  27.21 
 
 
295 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  30.1 
 
 
282 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  28.12 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  26.26 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  31.06 
 
 
323 aa  84  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  31.71 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 
265 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.29 
 
 
288 aa  83.2  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  26.91 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  26.26 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  28.32 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  27.46 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  31.97 
 
 
286 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  28.4 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  27.85 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  30.23 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  26.78 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  30.24 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.21 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  30.27 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  30.42 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  27.08 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  26.91 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  27.63 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.52 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  26.73 
 
 
294 aa  72.8  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  28.76 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  31.71 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  31.44 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  28.37 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  30.43 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  27.75 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  28.57 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  24.51 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  28.03 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  31.62 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  29.27 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  29.95 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  27.18 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  32.81 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  26.22 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  25 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  24.66 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  28.03 
 
 
301 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 
138 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1649  UspA domain-containing protein  26.42 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.5 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  27.72 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  24.53 
 
 
310 aa  63.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  25 
 
 
309 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  31.28 
 
 
310 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  23.93 
 
 
310 aa  62.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  20.68 
 
 
276 aa  62.8  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  27.52 
 
 
317 aa  62.8  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  28.16 
 
 
276 aa  62.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  24.42 
 
 
310 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  24.42 
 
 
310 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  24.42 
 
 
310 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 
188 aa  62.4  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.77 
 
 
297 aa  62.4  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  24.55 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  21.01 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  26.48 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.39 
 
 
151 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  32.26 
 
 
167 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  27.94 
 
 
138 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  24.26 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  32.47 
 
 
155 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  25.4 
 
 
449 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 
147 aa  60.1  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  28.5 
 
 
300 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  22.77 
 
 
310 aa  59.7  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
159 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  26.5 
 
 
305 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38400  universal stress protein family  27.39 
 
 
310 aa  59.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  35.81 
 
 
159 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  25.32 
 
 
303 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
159 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.73 
 
 
291 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  27.42 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  22.64 
 
 
278 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41440  hypothetical protein  24.89 
 
 
287 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 
151 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  25.11 
 
 
310 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  24.32 
 
 
309 aa  59.3  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.85 
 
 
288 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  27.62 
 
 
293 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  28.36 
 
 
297 aa  58.9  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  24.1 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>