90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1226 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  591  1e-168  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  74.56 
 
 		 286 aa  437  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  39.36 
 
 		 283 aa  215  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 		 284 aa  205  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  39.58 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  38.65 
 
 		 283 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  35.92 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  36.75 
 
 		 285 aa  188  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  37.41 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  36.62 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  38.95 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  37.63 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  31.1 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  32.97 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 281 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  34.47 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  34.47 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  34.47 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  32.75 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  32.89 
 
 		 284 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  32.29 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  31.8 
 
 		 283 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  29.69 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  30.03 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  34.95 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  24.56 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  26.07 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  26.43 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  26.86 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  25.61 
 
 		 278 aa  95.1  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  28.66 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  20.27 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  20.69 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  24.14 
 
 		 279 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  35.8 
 
 		 139 aa  57  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  24.34 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  24.62 
 
 		 449 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  22.75 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.23 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  22.18 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  26.4 
 
 		 281 aa  49.3  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  23.38 
 
 		 300 aa  48.9  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  27.62 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  29.27 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  21.72 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  21.72 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  21.72 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  21.72 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  21.72 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  21.72 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.83 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 277 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  24.56 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  21.61 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  24.56 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  23.56 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  26.67 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  26.02 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  28 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  24.86 
 
 		 271 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  22.84 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  26.11 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  29.41 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  31 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  25.68 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  20.62 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  25.33 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 		 162 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 141 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 		 145 aa  42.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  30.47 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  24.86 
 
 		 313 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  23.4 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  25.32 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  28.05 
 
 		 148 aa  42.7  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2236  hypothetical protein  25.41 
 
 		 273 aa  42.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  42.55 
 
 		 159 aa  42.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  24.32 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  24.04 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  27.78 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  27.32 
 
 		 298 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>