125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1630 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  100 
 
 		 278 aa  551  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  29.58 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  20.49 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  19.5 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  19.79 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  19.79 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  21.91 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  21.99 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  18.25 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  22.03 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  17.38 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  19.5 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  19.58 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  21.15 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  20.95 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  20.69 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  20.61 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  20.77 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  18.44 
 
 		 284 aa  72  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  19.44 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  19.44 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  20.07 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  19.44 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  25.78 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  19.51 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  22.94 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  20.42 
 
 		 283 aa  67  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  19.59 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  19.59 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  22.86 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  33.33 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  18.82 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  21.72 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  20.77 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  20.76 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  23.57 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  23.57 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  19.03 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  24.88 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  18.73 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  23.4 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  23.83 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  23.38 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  23.23 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  23.23 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.08 
 
 		 164 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  26.81 
 
 		 140 aa  50.8  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  27.7 
 
 		 148 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  21.67 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30.88 
 
 		 165 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0074  UspA domain-containing protein  27.34 
 
 		 140 aa  49.3  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.937758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  43.75 
 
 		 138 aa  48.9  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  19.4 
 
 		 273 aa  48.9  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  43.75 
 
 		 142 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0093  UspA domain protein  27.34 
 
 		 140 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.29194  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.21 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  23.24 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  24.09 
 
 		 140 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  20.23 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  33.91 
 
 		 145 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  31.82 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.87 
 
 		 157 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0134  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 141 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0818403 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  28.26 
 
 		 140 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  42.55 
 
 		 150 aa  45.4  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  24.34 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.04 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 128 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.57 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  29.09 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  27.01 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  27.62 
 
 		 141 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.58 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1741  hypothetical protein  25 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.447862  normal  0.301328 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  29.76 
 
 		 136 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1256  hypothetical protein  23.49 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.57 
 
 		 145 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.13 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  28.75 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 162 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  29.76 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  39.22 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  39.22 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  24.81 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  27.01 
 
 		 140 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  42.55 
 
 		 150 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4518  universal stress protein UspA family  21.09 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0105068  decreased coverage  0.00495689 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  35.37 
 
 		 130 aa  43.9  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  31.48 
 
 		 158 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  26.28 
 
 		 140 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  26.28 
 
 		 140 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  24.82 
 
 		 140 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  26.71 
 
 		 140 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  24.82 
 
 		 140 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  24.82 
 
 		 140 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>