184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1574 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  100 
 
 		 287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  100 
 
 		 287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  100 
 
 		 287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  45.55 
 
 		 285 aa  240  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  43.11 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  41.75 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 		 284 aa  215  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  38.73 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  40.56 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  37.46 
 
 		 283 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  41.28 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  38.16 
 
 		 281 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  37.85 
 
 		 288 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  36.01 
 
 		 284 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  36.01 
 
 		 284 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  37.85 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  41.55 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  39.01 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  35.82 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  36.71 
 
 		 284 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  39.58 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  37.81 
 
 		 283 aa  186  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  36.01 
 
 		 285 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  37.23 
 
 		 284 aa  178  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  35.52 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  37.1 
 
 		 281 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  36.75 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  36.21 
 
 		 281 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  34.47 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  33.68 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  30.53 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  28.72 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  25.35 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  25.7 
 
 		 284 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  25.96 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  25.86 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  19.44 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  27.67 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  25.69 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  33.56 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  27.39 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  27.36 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  37.23 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  28.98 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  28.41 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  29.04 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  25.89 
 
 		 298 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  29.21 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  27.68 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  29.53 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  21.25 
 
 		 449 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  27.68 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  27.22 
 
 		 270 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  26.53 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  28.32 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  25.95 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2567  UspA domain-containing protein  29.95 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.0044371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  29.89 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  26.76 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  22.22 
 
 		 151 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  24.19 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  25.59 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 		 279 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  29.45 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  32.72 
 
 		 273 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.65 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  26.26 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  26.63 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  23.39 
 
 		 287 aa  49.3  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  25.41 
 
 		 271 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  41.3 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  25.99 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  25.74 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  27.81 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 		 140 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  24.83 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  23.39 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  22.3 
 
 		 140 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2630  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  26.64 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  25.61 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  27.11 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  43.48 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3264  UspA domain protein  33.75 
 
 		 141 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  45.28 
 
 		 140 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  27.52 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  41.3 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 139 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  35.82 
 
 		 108 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  25.68 
 
 		 279 aa  46.6  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  27.33 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>