40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2345 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  587  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  97.54 
 
 		 284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  62.46 
 
 		 286 aa  378  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  31.21 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  28.22 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  30.39 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 283 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  26.99 
 
 		 312 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  29.23 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  28.98 
 
 		 284 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  29.54 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  30.5 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  26.43 
 
 		 287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  28.98 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  25.35 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  25.35 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  25.35 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  27.3 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  26.95 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  25.8 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  25.98 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  26.92 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  26.92 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  28.87 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  24.11 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  23.13 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  27.68 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  23.32 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  22.5 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  22.26 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  23.67 
 
 		 281 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  22.61 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  23.57 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  27.62 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  24.83 
 
 		 279 aa  48.9  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  30.07 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>