More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0944 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  100 
 
 		 283 aa  573  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  56.54 
 
 		 283 aa  328  9e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  55.75 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  51.06 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  51.06 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  49.65 
 
 		 285 aa  278  9e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  51.94 
 
 		 283 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  50.35 
 
 		 284 aa  275  7e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  50.36 
 
 		 312 aa  266  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  47.7 
 
 		 283 aa  265  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  47.69 
 
 		 285 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  42.05 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  46.79 
 
 		 284 aa  231  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  45.96 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  43.11 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  40.64 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  40.99 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  40.99 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  40.99 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  38.95 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  39.72 
 
 		 288 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  39.36 
 
 		 288 aa  195  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  38.65 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  37.76 
 
 		 283 aa  185  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  37.63 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  34.27 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  37.72 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  38.73 
 
 		 283 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  37.37 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  36.65 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  26.43 
 
 		 286 aa  139  7.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 286 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  30.5 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  29.79 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  27.56 
 
 		 278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  26.48 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  27.37 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  20.42 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  29.52 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  30.58 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  30.8 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 271 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  29.05 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  29.28 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  32.78 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  24.85 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  30.8 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2617  UspA domain-containing protein  26.7 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  27.31 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  32.21 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  32.89 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  31.14 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  30.87 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  34.9 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  29.11 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  37.08 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  36.19 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  29.15 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.06 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  26.34 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  29.53 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  30.25 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  30.56 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  30.46 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0110  UspA domain-containing protein  34.57 
 
 		 140 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  26.56 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.32 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.89 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  34.04 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  28.27 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  26.07 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  28.27 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  32.94 
 
 		 136 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  26.57 
 
 		 164 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  34.29 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  30.2 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  30.59 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3269  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.17581  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  24.9 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  25.67 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  25.37 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  28.51 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  39.13 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  29.74 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0395  UspA domain-containing protein  30.95 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  35.21 
 
 		 150 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  28.8 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  24.58 
 
 		 283 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  31.33 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  29.75 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  30.67 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>