107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0420 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0420  UspA domain protein  100 
 
 		 164 aa  323  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.249948  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0228  hypothetical protein  46.75 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0238  UspA domain-containing protein  46.75 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0218  UspA domain-containing protein  46.75 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4458  UspA domain protein  48.05 
 
 		 200 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0969362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0255  UspA domain-containing protein  43.42 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951611 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0416  UspA domain-containing protein  42.42 
 
 		 161 aa  97.8  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0605514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  41.94 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  29.22 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  30.13 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0174  UspA domain protein  31.87 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.102969  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  26.92 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0253  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 130 aa  51.2  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.157205 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  27.63 
 
 		 140 aa  50.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  26.42 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  38.37 
 
 		 280 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.11 
 
 		 150 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.72 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3100  UspA domain protein  29.41 
 
 		 292 aa  48.5  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512511  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  27.81 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  27.81 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  26.88 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.45 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  28.48 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  29.49 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  28.83 
 
 		 282 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  30.26 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  52.5 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  29.61 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  22.58 
 
 		 287 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  50 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  26.11 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  25.32 
 
 		 187 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 128 aa  44.7  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.1 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  22.93 
 
 		 287 aa  44.3  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  29.8 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0990  hypothetical protein  29.81 
 
 		 277 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1008  UspA domain-containing protein  29.81 
 
 		 277 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1018  UspA domain-containing protein  29.81 
 
 		 277 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.4 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4577  UspA domain-containing protein  29.82 
 
 		 294 aa  43.9  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.309557  decreased coverage  0.000132557 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 274 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  28.76 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2814  UspA domain protein  31.79 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000545655  hitchhiker  0.00186691 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  30.36 
 
 		 276 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  30.49 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  26.47 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  29.11 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  26.47 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  26.14 
 
 		 291 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  26.47 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  27.22 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  39.06 
 
 		 290 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  25.66 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  30.72 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  22.44 
 
 		 287 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  27.64 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.72 
 
 		 145 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  38.89 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  27.22 
 
 		 164 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  29.87 
 
 		 148 aa  42  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 148 aa  42  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  40.82 
 
 		 147 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  42.31 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  31.76 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  28.4 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.78 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  39.13 
 
 		 120 aa  41.2  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  31.63 
 
 		 324 aa  41.2  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0550  UspA domain-containing protein  25.61 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  39.58 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 		 139 aa  41.2  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  30 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  30 
 
 		 170 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  41.07 
 
 		 301 aa  41.2  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  33.85 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 140 aa  41.2  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  27.89 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  28.4 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  41.3 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  38.89 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  25.81 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  27.16 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  27.16 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>