21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3544 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3544  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  655    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3543  UspA domain protein  36.43 
 
 		 293 aa  182  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  24.49 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3232  UspA domain-containing protein  23.1 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.499848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5771  UspA domain protein  25.17 
 
 		 280 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  20.59 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  21.65 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  24.21 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  24.03 
 
 		 276 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  28.92 
 
 		 296 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  24.38 
 
 		 275 aa  52.4  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  27.59 
 
 		 153 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  28.17 
 
 		 152 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  22.22 
 
 		 277 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0767  UspA domain protein  21.51 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  22.89 
 
 		 278 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  27.4 
 
 		 152 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  22.22 
 
 		 147 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  23.88 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  24.39 
 
 		 298 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>