277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11652 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11652  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  288  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.615716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  76.19 
 
 
148 aa  224  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  76.19 
 
 
148 aa  224  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  76.19 
 
 
148 aa  224  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  76.19 
 
 
147 aa  224  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  76.19 
 
 
147 aa  224  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2864  UspA domain protein  65.31 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2426  UspA domain protein  57.43 
 
 
148 aa  166  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.384614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  55.03 
 
 
152 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28580  universal stress protein UspA-like protein  55.03 
 
 
149 aa  135  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2291  UspA domain protein  54.36 
 
 
152 aa  133  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000481924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4166  UspA domain protein  52.98 
 
 
152 aa  127  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.441072  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0390  UspA domain-containing protein  50 
 
 
133 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  37.41 
 
 
148 aa  84  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.86 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 
166 aa  66.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  36.73 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  33.77 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.84 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  32.89 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3952  UspA domain protein  36.24 
 
 
166 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  32.67 
 
 
166 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  31.94 
 
 
165 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  28.39 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  34.46 
 
 
295 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
295 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.79 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 
295 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  30.67 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  26.75 
 
 
157 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  35.17 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.7 
 
 
150 aa  57  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  32 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  30.14 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  32 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.14 
 
 
150 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  30.87 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0098  universal stress protein  34.25 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  29.45 
 
 
152 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.86 
 
 
288 aa  53.9  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  26.76 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.62 
 
 
284 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  31.94 
 
 
145 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  27.46 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  26.76 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  26.76 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  31.9 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  30.87 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  26.76 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  31.41 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  26.76 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.1 
 
 
290 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  26.76 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  27.81 
 
 
139 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  29.66 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  33.76 
 
 
143 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 
147 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  34 
 
 
289 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  28.28 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  26.8 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  30.46 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  27.46 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  34.51 
 
 
277 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  28.86 
 
 
148 aa  50.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  26.76 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  26.9 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  26.14 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.27 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  27.7 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  30.26 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.41 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  30.77 
 
 
300 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  30.38 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 
294 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  28.38 
 
 
153 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1229  hypothetical protein  30.32 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>