140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3952 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3952  UspA domain protein  100 
 
 		 166 aa  322  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  39.61 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2291  UspA domain protein  38.93 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000481924  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  34.62 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  34.62 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  34.39 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11652  hypothetical protein  36.24 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.615716 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  32.91 
 
 		 345 aa  61.2  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2864  UspA domain protein  36 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  32.89 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28580  universal stress protein UspA-like protein  37.01 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4166  UspA domain protein  34.21 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.441072  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  24.83 
 
 		 159 aa  50.8  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.75 
 
 		 150 aa  50.8  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  26.75 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  26.14 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  30.14 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  28.48 
 
 		 148 aa  48.9  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  34.84 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.61 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.67 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  42.67 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2426  UspA domain protein  32.28 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.384614  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 128 aa  47.8  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  25.68 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.03 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  25.14 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  29.05 
 
 		 317 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  34.44 
 
 		 277 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  28.19 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  27.92 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1740  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0341137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  27.81 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 188 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  30.2 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  29.55 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  35.25 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  24.49 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  43.86 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  48.28 
 
 		 289 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  29.22 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.75 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  24.57 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  24.57 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  24.57 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  24.57 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.8 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  24.57 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  24.57 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  24.57 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  42.11 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 145 aa  45.1  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  28.95 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3288  universal stress protein  32.32 
 
 		 308 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  24.57 
 
 		 152 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  37.67 
 
 		 143 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 		 154 aa  44.3  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.67 
 
 		 151 aa  44.3  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.24 
 
 		 280 aa  44.3  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  26.67 
 
 		 149 aa  44.3  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  34.52 
 
 		 305 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1774  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 289 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  30 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  27.78 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0340  UspA domain protein  41.51 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  27.4 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  39.44 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  27.52 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  22.76 
 
 		 274 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  27.97 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  41.07 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  26.85 
 
 		 150 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  28.22 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  27.1 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 151 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>