130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2426 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2426  UspA domain protein  100 
 
 		 148 aa  294  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.384614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2864  UspA domain protein  59.46 
 
 		 148 aa  166  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11652  hypothetical protein  57.43 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.615716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  55.7 
 
 		 147 aa  159  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  54.36 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  54.36 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  54.36 
 
 		 148 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  53.69 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28580  universal stress protein UspA-like protein  58.28 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4166  UspA domain protein  52.63 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.441072  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2291  UspA domain protein  50.67 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000481924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  36.49 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0390  UspA domain-containing protein  45.38 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.45 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  29.8 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.19 
 
 		 290 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.93 
 
 		 288 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.69 
 
 		 284 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  28.28 
 
 		 295 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 295 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 295 aa  52  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  32.21 
 
 		 341 aa  51.6  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 294 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  31.94 
 
 		 297 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.25 
 
 		 143 aa  50.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0968  UspA domain-containing protein  32.24 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.848779  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  31.13 
 
 		 317 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  27.03 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  29.14 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  24.65 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  28.08 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  24.65 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  28.19 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  24.65 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  24.65 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  24.65 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  24.65 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4144  UspA domain protein  33.75 
 
 		 307 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3812  UspA domain protein  28.95 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3952  UspA domain protein  32.28 
 
 		 166 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 137 aa  47.4  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  27.52 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.97 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  29.17 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4985  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 		 275 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 		 291 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  30.2 
 
 		 345 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  27.81 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  26.76 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.11 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  25.49 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  32.86 
 
 		 277 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  36.96 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  33.8 
 
 		 277 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  23.94 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  26.85 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  26.85 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  26.85 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  26.85 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  27.89 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 295 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  33.56 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  26.85 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  24.65 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  26.85 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  26.85 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  26.85 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  23.94 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  37.88 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.51 
 
 		 277 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  23.94 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  25.66 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2842  UspA domain protein  37.14 
 
 		 305 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.360925  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  26.57 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  31.97 
 
 		 288 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  22.88 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  32.87 
 
 		 307 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  26.57 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  31.69 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  26.17 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  24.84 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  26.71 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0396  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  25.49 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5551  UspA domain protein  29.22 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.883405 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>