84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0390 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0390  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 133 aa  253  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.422401  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3342  UspA domain-containing protein  53.79 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537895  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3551  UspA domain-containing protein  53.03 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11652  hypothetical protein  52.27 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.615716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  50.76 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  50.76 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  50.76 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2426  UspA domain protein  44.85 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.384614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5918  hypothetical protein  46.32 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.0290326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2864  UspA domain protein  47.79 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2291  UspA domain protein  41.35 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000481924  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28580  universal stress protein UspA-like protein  41.38 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.243649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4166  UspA domain protein  41.04 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.441072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  38.81 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  40.24 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.08 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  29.55 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  29.55 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  34.04 
 
 		 287 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3952  UspA domain protein  35.82 
 
 		 166 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  31.78 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  44.83 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  46.43 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  39.47 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.78 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.78 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  41.79 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4578  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.911716  decreased coverage  0.000114407 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  30.1 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  33.59 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.87 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  36.25 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  33.33 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  34.57 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  45.21 
 
 		 280 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  38.55 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3647  UspA domain protein  51.92 
 
 		 183 aa  42  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000125254  normal  0.0586956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2065  universal stress protein UspE  31.58 
 
 		 311 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  40.74 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.78 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  36.84 
 
 		 290 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  44.64 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  39.29 
 
 		 142 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 144 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  27.13 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  28.99 
 
 		 152 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2938  universal stress protein  27.69 
 
 		 297 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 162 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  36 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  38.55 
 
 		 164 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  35.44 
 
 		 297 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  38.55 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  27.78 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  27.27 
 
 		 296 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  35.82 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  36 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  28.99 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  36.84 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2169  hypothetical protein  31.34 
 
 		 309 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.199565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  46 
 
 		 217 aa  40.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  31.3 
 
 		 291 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  30.23 
 
 		 291 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  28.26 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  28.26 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  28.26 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  28.26 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  28.26 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3218  universal stress protein  25.83 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  28.26 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  43.48 
 
 		 281 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  28.26 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  28.26 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2640  UspA domain protein  39.39 
 
 		 150 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  38.18 
 
 		 140 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  37.29 
 
 		 151 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  30.23 
 
 		 309 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>