More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2716 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2716  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  317  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  45.68 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  40.25 
 
 		 300 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  43.51 
 
 		 297 aa  88.2  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  43.79 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0104  hypothetical protein  41.88 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  41.29 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  37.09 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  42.94 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  39.86 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  36.42 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.82 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  39.18 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  30.97 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  29.53 
 
 		 141 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  29.41 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  29.73 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  30.2 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.67 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  32.48 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  29.45 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2086  UspA domain protein  35.98 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1819  hypothetical protein  39.13 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  28.75 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  29.58 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1633  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.440039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  26.85 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4023  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  32.45 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  32.45 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  38.16 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4735  universal stress protein  30.63 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0233182  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  31.71 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  30.32 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  28.19 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1574  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  27.71 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1513  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.224479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  28.76 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  33.99 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1117  hypothetical protein  30 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1493  UspA domain-containing protein  30.63 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1597  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  33.99 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2142  hypothetical protein  35.29 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  31.45 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  24.39 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  27.15 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.83 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.45 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2474  putative universal stress protein, UspA  32.05 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  32.32 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25040  hypothetical protein  35.29 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  27.38 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  32.26 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1769  UspA domain protein  31.41 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  29.88 
 
 		 304 aa  52  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  29.38 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.8 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 140 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1640  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  35.03 
 
 		 289 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  34.81 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  33.54 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1215  universal stress protein  29.87 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0840426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1702  universal stress protein  29.87 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0359  universal stress protein  29.87 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  27.85 
 
 		 150 aa  51.2  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1856  universal stress family protein  29.87 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.509288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0802  universal stress family protein  29.87 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  33.99 
 
 		 140 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  32.89 
 
 		 283 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  29.53 
 
 		 140 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  29.38 
 
 		 168 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  35.9 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  31.33 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  32.7 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  29.94 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 282 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  32.7 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1841  universal stress family protein  29.87 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  26 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2010  DNA binding protein  29.87 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  27.85 
 
 		 152 aa  50.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  35.9 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  30.97 
 
 		 415 aa  50.8  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.67 
 
 		 147 aa  50.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  34.48 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  32.5 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2484  universal stress protein  30.52 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121813  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  32.91 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>