More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0751 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0898  UspA domain protein  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0751  universal stress family protein  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  37.93 
 
 		 155 aa  94.4  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  34.93 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  34.93 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  90.5  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  36.99 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  36.99 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  36.99 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  37.5 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  38.19 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  36.62 
 
 		 146 aa  86.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  36.99 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  34.25 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  35.57 
 
 		 151 aa  84.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  37.41 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  36.99 
 
 		 162 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  34.25 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  34.46 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  36.11 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  34.03 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  36.73 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  35.57 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  34.03 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  35.42 
 
 		 187 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 150 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  36.49 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  35.76 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  34.46 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  35.76 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  33.78 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  32.88 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  33.56 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  36.99 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  33.77 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  31.33 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  33.11 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  33.33 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  37.97 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  34.25 
 
 		 161 aa  72  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  34 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.25 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  34.46 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  32.64 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  32.64 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  32.64 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  31.51 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  32.64 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1158  universal stress family protein  32.64 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  36.3 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0755  universal stress protein  32.64 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  32.64 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  32.64 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  32.64 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  32.64 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  32.64 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  33.77 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  33.55 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  33.78 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  33.1 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1136  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  33.56 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  34.27 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  33.58 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  31.72 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.97 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  32.64 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  33.56 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  33.78 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  34.44 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  33.56 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  32.19 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  35.37 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.67 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>