174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2342 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  100 
 
 		 304 aa  634    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  53.85 
 
 		 296 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  36.21 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  36.12 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  33.11 
 
 		 305 aa  152  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  32.44 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  30.56 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28.83 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.07 
 
 		 320 aa  79  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  25.5 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.34 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  27.65 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25.85 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  29 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  24.39 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  27.82 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  23.93 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  31.97 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  27.27 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  25.33 
 
 		 415 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.36 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  31.37 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  26.04 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  25.89 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  30.61 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  31.95 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  25.35 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  24.83 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.29 
 
 		 151 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  30.94 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.43 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  30 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  27.41 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  26.32 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  30.67 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  28.35 
 
 		 306 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 148 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  25.93 
 
 		 283 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  25.93 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  32.45 
 
 		 154 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 151 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 162 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 145 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 151 aa  52.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 147 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.71 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  31.69 
 
 		 148 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  27.4 
 
 		 150 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  27.15 
 
 		 150 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  30.22 
 
 		 160 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  21.34 
 
 		 274 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  30.99 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 145 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  26.02 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  30.77 
 
 		 162 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  26.02 
 
 		 271 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 145 aa  50.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  30.07 
 
 		 145 aa  50.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  24.32 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  25.42 
 
 		 283 aa  49.3  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2821  hypothetical protein  26.67 
 
 		 149 aa  49.3  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0804711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  28.37 
 
 		 143 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  23.23 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.37 
 
 		 159 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0609  UspA domain protein  20 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  22.31 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  24 
 
 		 280 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  26.24 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  26.97 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  27.09 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.97 
 
 		 141 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  25.78 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  28.4 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  26.19 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  27.37 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  30.56 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  28 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  22.98 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  26.19 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  24.76 
 
 		 294 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  28.18 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  23.96 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  28.39 
 
 		 150 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  34.75 
 
 		 128 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  26.18 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  31.82 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  26.35 
 
 		 515 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  28.17 
 
 		 145 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  31.3 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  31.3 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  28.57 
 
 		 154 aa  47  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>