32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1225 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  100 
 
 		 301 aa  590  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  55.4 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  55.4 
 
 		 295 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  55.4 
 
 		 295 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  51.22 
 
 		 290 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  38.62 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  38.05 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0839  UspA domain protein  37.64 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  28.91 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  32.13 
 
 		 293 aa  97.1  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  30.8 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  26.07 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  31.67 
 
 		 320 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  30.66 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  30.38 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  30.54 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  30.54 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  30.54 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  29.18 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  28.65 
 
 		 324 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  26.46 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4857  hypothetical protein  39.06 
 
 		 124 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.16769 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  27.69 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  25.49 
 
 		 415 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  26.26 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  24.88 
 
 		 315 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  26.67 
 
 		 151 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  23.35 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  26.92 
 
 		 282 aa  42.7  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>