49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1181 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  100 
 
 
295 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  99.66 
 
 
295 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  55.4 
 
 
301 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  46.74 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  44.67 
 
 
289 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  39.79 
 
 
286 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 
311 aa  185  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  42.01 
 
 
286 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  34.36 
 
 
300 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  27.92 
 
 
294 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  29.35 
 
 
302 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0839  UspA domain protein  37.96 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  26.85 
 
 
292 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  32.07 
 
 
320 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 
295 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  31.34 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  33.55 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  29.14 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 
292 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  31.99 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.23 
 
 
283 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4857  hypothetical protein  38.24 
 
 
124 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.16769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4679  UspA domain protein  35.92 
 
 
142 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  29.84 
 
 
297 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  28.3 
 
 
415 aa  48.9  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.29 
 
 
290 aa  48.9  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  31.72 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30.83 
 
 
155 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 
294 aa  47  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 
295 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.24 
 
 
139 aa  47  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  25.35 
 
 
295 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  25.4 
 
 
284 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  25.35 
 
 
295 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  24.48 
 
 
282 aa  46.2  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1249  hypothetical protein  26.32 
 
 
154 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.17939  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  31.72 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  23.86 
 
 
320 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  31.03 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  26.25 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  32.53 
 
 
274 aa  44.3  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  31.13 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  30.15 
 
 
142 aa  43.9  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  28.26 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.93 
 
 
314 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1584  UspA domain protein  27.18 
 
 
295 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  29.91 
 
 
311 aa  42.4  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>