84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3381 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  100 
 
 
292 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  100 
 
 
292 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  67.12 
 
 
295 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  33.22 
 
 
292 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  33.55 
 
 
294 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  32.41 
 
 
320 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  36.03 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  31.97 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 
311 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  29.9 
 
 
286 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  30.79 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  31.62 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  30.54 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  29.14 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  28.09 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  28.72 
 
 
290 aa  66.6  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  26.97 
 
 
329 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  27.88 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  27.65 
 
 
310 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  27.15 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.13 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0839  UspA domain protein  32.93 
 
 
282 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  26.75 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  26.71 
 
 
143 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  20.61 
 
 
275 aa  53.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  27.42 
 
 
297 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  23.32 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.92 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  25 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  32.08 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  32.08 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  27.55 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  29.46 
 
 
293 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  29.46 
 
 
293 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  28.64 
 
 
321 aa  49.3  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  26.21 
 
 
139 aa  49.3  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  27.61 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  29.28 
 
 
293 aa  48.9  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.73 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 
141 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  26.78 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  29.63 
 
 
317 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  23.94 
 
 
142 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  27.03 
 
 
143 aa  46.6  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  25.85 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  27.17 
 
 
296 aa  46.2  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 
145 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  30.17 
 
 
146 aa  46.2  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  26.87 
 
 
306 aa  45.8  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  30.85 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  24.14 
 
 
301 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3034  hypothetical protein  28.76 
 
 
314 aa  45.8  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.941383  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  24.03 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  27.46 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  30.17 
 
 
146 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  28.17 
 
 
147 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  30.5 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  26.79 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  29.81 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  23.47 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  28.77 
 
 
289 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  27.08 
 
 
283 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  20.47 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  28.02 
 
 
307 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.14 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  28.15 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  37.5 
 
 
148 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1706  universal stress protein  36.73 
 
 
130 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0360451  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  25.75 
 
 
341 aa  43.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.55 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  34.21 
 
 
151 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  32.9 
 
 
295 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  26.16 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  32.09 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  24.11 
 
 
140 aa  42.7  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  27.23 
 
 
273 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  41.1 
 
 
155 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  34.29 
 
 
276 aa  42.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  27.01 
 
 
310 aa  42.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>