39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1204 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1204  UspA domain protein  100 
 
 		 293 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3791  UspA domain protein  43.24 
 
 		 294 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12342  hypothetical protein  44.41 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5365  UspA domain protein  43.64 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3381  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1999  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3432  UspA domain-containing protein  36.03 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3370  hypothetical protein  36.03 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2796  hypothetical protein  35.25 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2222  UspA domain protein  36.09 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468875  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1225  UspA domain protein  33.55 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3093  UspA domain-containing protein  33.45 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.294226  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1208  UspA domain-containing protein  34.09 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.041465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1198  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.189932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1181  hypothetical protein  33.55 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.751556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0041  UspA domain-containing protein  29.67 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4854  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1573  UspA domain-containing protein  32.88 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0490194  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1238  UspA domain protein  34.51 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162205  normal  0.323572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2015  UspA domain protein  32.31 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1938  UspA domain protein  27.83 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  32.03 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  27.27 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  30.54 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  31.47 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.02 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  29.82 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  36.62 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  37.93 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  25.76 
 
 		 159 aa  44.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0942  UspA domain protein  30.73 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.536169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  57.5 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  32.26 
 
 		 140 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2846  hypothetical protein  29.66 
 
 		 145 aa  44.3  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2190  UspA domain-containing protein  52.5 
 
 		 148 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  25.63 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  28.96 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  32.29 
 
 		 287 aa  42.7  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.95 
 
 		 159 aa  42.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>