143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2890 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2890  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 296 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3156  universal stress protein  91.89 
 
 		 296 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.318164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2558  UspA domain-containing protein  91.89 
 
 		 296 aa  557  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2699  UspA domain-containing protein  91.55 
 
 		 296 aa  557  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  36.96 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  40.59 
 
 		 311 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3340  universal stress protein  37.75 
 
 		 315 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3237  universal stress protein  35.14 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2453  UspA domain-containing protein  35.69 
 
 		 296 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3031  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.497745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3008  UspA domain-containing protein  32.11 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2470  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595783  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3288  universal stress protein  33.66 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2745  universal stress protein  31.1 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1667  universal stress protein family  35.03 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3344  hypothetical protein  34.44 
 
 		 307 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  30.29 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3029  UspA domain-containing protein  31.88 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  28.43 
 
 		 309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  27.12 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3347  hypothetical protein  31.21 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2468  UspA domain-containing protein  31.6 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51316  normal  0.507158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3290  universal stress protein  30.62 
 
 		 308 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  26.71 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  27.12 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  27.78 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  26.14 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  26.47 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  25.32 
 
 		 311 aa  99.4  6e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  26.47 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  26.47 
 
 		 310 aa  95.1  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  26.14 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  26.14 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  26.14 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2065  universal stress protein UspE  25.57 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2106  universal stress protein UspE  26.38 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  25.82 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2399  universal stress protein UspE  26.06 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3260  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1545  universal stress protein UspE  25.73 
 
 		 316 aa  89  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01310  stress-induced protein  25.73 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2312  UspA domain protein  25.73 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.172993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1980  universal stress protein UspE  25.73 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.420697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1851  universal stress protein UspE  26.06 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1832  universal stress protein UspE  24.84 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1449  universal stress protein UspE  25.73 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2583  universal stress protein UspE  26.06 
 
 		 320 aa  89  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01320  hypothetical protein  25.73 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1943  universal stress protein UspE  24.84 
 
 		 318 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2292  universal stress protein UspE  25.73 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1789  universal stress protein UspE  25.73 
 
 		 316 aa  89  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3294  universal stress protein  26.23 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.949607  normal  0.779527 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1784  universal stress protein UspE  25.41 
 
 		 315 aa  86.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334213  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1846  universal stress protein UspE  25.41 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1490  universal stress protein UspE  25.41 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0578551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1786  universal stress protein UspE  25.41 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38400  universal stress protein family  30.77 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3296  universal stress protein  21.75 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  24.84 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  24.84 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  24.84 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  24.84 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  24.84 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  22.36 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1672  universal stress protein UspE  25.08 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0632813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4897  hypothetical protein  30.13 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  24.56 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  26.32 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  23.78 
 
 		 315 aa  79  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56220  hypothetical protein  29.87 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3432  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.85473  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1044  universal stress protein UspE  23.38 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.106711  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1572  universal stress protein UspE  23.05 
 
 		 314 aa  72.4  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  26.99 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  26.98 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  24.03 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2187  universal stress protein  28.67 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1811  UspA domain-containing protein  32.63 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003476  universal stress protein E  21.63 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  26.07 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  25.32 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2451  UspA domain-containing protein  29.86 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.512934 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2938  universal stress protein  23.51 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41440  hypothetical protein  26.48 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2576  UspA domain-containing protein  25.78 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140838  hitchhiker  0.00089263 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  29.05 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3514  hypothetical protein  26.74 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0629  UspA domain-containing protein  24.45 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  30.41 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3550  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0504  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00200377  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3393  hypothetical protein  27 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2765  UspA domain-containing protein  29.02 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  27.45 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03146  Universal stress protein, UspA  26.32 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747468  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2080  universal stress protein A  27.03 
 
 		 144 aa  52.4  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1041  UspA domain-containing protein  20 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  24.59 
 
 		 326 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0102  universal stress protein family protein  27.21 
 
 		 144 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0988  UspA domain-containing protein  21.74 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>