269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0949 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0949  UspA domain protein  100 
 
 		 331 aa  624  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132652  normal  0.0181278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.58 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  38.72 
 
 		 288 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  35.23 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  35 
 
 		 285 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  36.18 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  35.9 
 
 		 293 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  35.5 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  34.46 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  36.04 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  33.11 
 
 		 292 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  35.64 
 
 		 284 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.89 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.92 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  32.47 
 
 		 317 aa  93.2  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  35.06 
 
 		 288 aa  92.8  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  33.87 
 
 		 296 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  32.78 
 
 		 294 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  37.62 
 
 		 321 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  34.43 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  32.78 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  32.78 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1412  hypothetical protein  36.36 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.48566  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  32.77 
 
 		 293 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  35.5 
 
 		 293 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 290 aa  90.1  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  34.42 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  31.88 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 		 287 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  31.78 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  35.24 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5276  UspA domain protein  35.64 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  33.67 
 
 		 289 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  38.18 
 
 		 283 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  34.27 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4809  hypothetical protein  36.44 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  35.12 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  35.12 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  35.12 
 
 		 292 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  33.78 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  35.18 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  32.25 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  35.18 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  35.18 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  35.5 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  31.37 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  31.86 
 
 		 307 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3041  putative stress-inducible protein  36.36 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.921902  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  34.01 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  32.34 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  36.57 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0383  UspA domain-containing protein  33.65 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0290  UspA domain protein  40.51 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0544727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  32.01 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06810  universal stress protein UspA-like protein  33 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1870  UspA domain-containing protein  44.08 
 
 		 147 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  37.42 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  32.51 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  32.14 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  31.68 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  32.48 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  34.98 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  34.8 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  33.22 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  33.12 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  33.01 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01830  universal stress protein UspA-like protein  34.06 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  36.49 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  33 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  32.26 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  30.13 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  37.13 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  34.13 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1447  UspA domain protein  36.43 
 
 		 147 aa  73.9  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  29.57 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2069  UspA domain protein  32.31 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000374133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1072  hypothetical protein  35.35 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1088  UspA domain-containing protein  35.35 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103411  normal  0.107054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  35.22 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  38.13 
 
 		 144 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2336  UspA domain-containing protein  42.2 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.71731  normal  0.885164 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  28.15 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  27.61 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  33.33 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4842  hypothetical protein  32.31 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22920  universal stress protein UspA-like protein  34.62 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27256  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  33.89 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0604  UspA domain protein  33.02 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  38.81 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  40.91 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0118  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4805  hypothetical protein  30.39 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.595462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1935  UspA domain protein  37.32 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>