More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0249 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0249  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 147 aa  295  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3490  universal stress protein  49.66 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.267161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  41.38 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  38.62 
 
 		 144 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  39.31 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  39.31 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  39.31 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  39.31 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  39.31 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  39.31 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  39.31 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  39.31 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  37.93 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  37.24 
 
 		 144 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  37.24 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  33.79 
 
 		 147 aa  90.1  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  35.17 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  34.48 
 
 		 168 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  39.31 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  39.31 
 
 		 144 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  36.3 
 
 		 144 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  33.79 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  33.79 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  34.01 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  32.41 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  32.88 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  29.73 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  30.14 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  30.61 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  30.61 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  30.82 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  34.01 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  31.29 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  26.53 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  30.82 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  35.14 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  31.97 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  28.08 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  31.97 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  26.71 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  26.71 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  34.69 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 148 aa  67  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  28.67 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  30.14 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  28.08 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  28.48 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  30.14 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  34.23 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  30.87 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  28.97 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  32.43 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  28.77 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  29.8 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  29.93 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  30.14 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  29.25 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  30.87 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  32.41 
 
 		 390 aa  57.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  30.2 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  28.48 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  28.48 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  28.48 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  28.48 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  28.48 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  28.19 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  28.19 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  31.72 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.38 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  28.95 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  28.95 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  30.2 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  31.29 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  25.49 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  28.08 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  28 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>