105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1331 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  49.84 
 
 		 307 aa  301  7.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  39.2 
 
 		 307 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  38.11 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 323 aa  192  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  33.23 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  33.76 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  25.64 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  29.38 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 150 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0048  hypothetical protein  26.07 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0497  UspA domain protein  24.79 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  30.37 
 
 		 139 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  25.3 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  25.47 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  22.88 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  24.7 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  24.14 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  24.83 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  36.78 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  26.58 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  23.68 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  30 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 137 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  27.04 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  29.44 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  24.48 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  24.17 
 
 		 319 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  24.5 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.71 
 
 		 143 aa  52.8  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  24.17 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1237  hypothetical protein  19.87 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.454178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  30.65 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1177  UspA domain protein  24.22 
 
 		 211 aa  50.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368824  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  27.07 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 137 aa  48.9  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  26.75 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  28.67 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.37 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  28.76 
 
 		 143 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  30.68 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  24.03 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  26.8 
 
 		 147 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 		 137 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  21.86 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  23.12 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  24.9 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  28.67 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  24.63 
 
 		 145 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  24.82 
 
 		 141 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  26.52 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  29.2 
 
 		 156 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  25.81 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  28.76 
 
 		 147 aa  46.6  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  24.63 
 
 		 140 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  30.83 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  27.41 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  21.35 
 
 		 289 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  28.06 
 
 		 149 aa  46.2  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 		 144 aa  46.2  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  22.53 
 
 		 295 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 145 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 295 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1110  UspA domain protein  25 
 
 		 313 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237274  normal  0.260394 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  28.11 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  22.45 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2436  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 140 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  28.36 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  23.68 
 
 		 286 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  26.97 
 
 		 160 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1331  universal stress protein UspA  29.85 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  28.03 
 
 		 137 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2528  UspA domain protein  29.85 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08260  universal stress protein UspA-like protein  22.52 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.144181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  25.5 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.08 
 
 		 150 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  27.74 
 
 		 151 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2624  UspA domain protein  29.1 
 
 		 140 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  27.04 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  27.78 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  27.61 
 
 		 142 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.26 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  26.92 
 
 		 139 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  23.08 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2992  hypothetical protein  29.08 
 
 		 148 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3036  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 148 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3007  UspA domain-containing protein  29.08 
 
 		 148 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.015244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  25.48 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  25.19 
 
 		 161 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  24.12 
 
 		 286 aa  43.1  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  26.8 
 
 		 147 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  22.48 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  25.39 
 
 		 321 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>