More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5116 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5116  UspA domain protein  100 
 
 		 231 aa  461  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  34.38 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  31.36 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  31.17 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  31.17 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  31.17 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  31.17 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  30.72 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  31.01 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  28.12 
 
 		 164 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  40.91 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  31.01 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  58.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.38 
 
 		 153 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  28.12 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.37 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  30.07 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  30.07 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  30.07 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  26.49 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  32.45 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  45.16 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  29.68 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  26.38 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  29.45 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  30.07 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  29.22 
 
 		 310 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0515  universal stress protein  36.67 
 
 		 151 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.0014722  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  31.85 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  45 
 
 		 139 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  29.19 
 
 		 159 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  27.45 
 
 		 150 aa  53.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  30.58 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 162 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  28.92 
 
 		 314 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  29.93 
 
 		 141 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  25.95 
 
 		 152 aa  52.8  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  32.14 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  33.58 
 
 		 152 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.48 
 
 		 149 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  29.87 
 
 		 150 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  25.49 
 
 		 153 aa  52.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  29.87 
 
 		 310 aa  52.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  28.1 
 
 		 309 aa  52.4  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  31.08 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  26 
 
 		 152 aa  51.6  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  30.69 
 
 		 200 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.33 
 
 		 155 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14170  universal stress protein, UspA family  30.52 
 
 		 146 aa  51.6  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1511  UspA domain protein  27.81 
 
 		 151 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0692  UspA domain protein  31.31 
 
 		 157 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  30.32 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2705  UspA domain protein  27.81 
 
 		 151 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000991163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.99 
 
 		 156 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  35.82 
 
 		 141 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  28.03 
 
 		 147 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  27.98 
 
 		 153 aa  50.8  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  31.71 
 
 		 162 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  41.51 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3645  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 151 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000262927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  25.97 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 145 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  25.81 
 
 		 311 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  31.17 
 
 		 148 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 143 aa  50.4  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  30.77 
 
 		 150 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  29.86 
 
 		 140 aa  50.1  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  29.87 
 
 		 164 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 145 aa  50.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  33.81 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  39.39 
 
 		 141 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  25.32 
 
 		 157 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 		 163 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  36.56 
 
 		 303 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 167 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  28.85 
 
 		 310 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  41.27 
 
 		 288 aa  49.3  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  29.51 
 
 		 152 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3101  UspA domain protein  34.94 
 
 		 151 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  32.09 
 
 		 141 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  26.9 
 
 		 622 aa  48.9  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  28 
 
 		 143 aa  48.9  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  27.37 
 
 		 294 aa  48.9  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  30 
 
 		 162 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  42.37 
 
 		 297 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  29.14 
 
 		 291 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  29.25 
 
 		 138 aa  48.5  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  24.69 
 
 		 177 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3794  UspA domain protein  31.78 
 
 		 301 aa  48.5  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>