171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0159 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  316  9e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  31.17 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 323 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  32.92 
 
 		 313 aa  77  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  32.48 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 310 aa  67.8  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  28.4 
 
 		 310 aa  67.8  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  27.97 
 
 		 313 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1177  UspA domain protein  30.41 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  28.67 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  25.88 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  29.41 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 		 314 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  28.08 
 
 		 288 aa  60.8  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  34.23 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  28.83 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  26.59 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  30.13 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  29.19 
 
 		 307 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  32.89 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  26.16 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  25.85 
 
 		 307 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5820  UspA domain-containing protein  24.2 
 
 		 318 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131616 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  26.62 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  28.65 
 
 		 164 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1102  UspA domain-containing protein  24.2 
 
 		 319 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  28.08 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  26.72 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0436  hypothetical protein  40 
 
 		 802 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  28.07 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  25.77 
 
 		 157 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.46 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  24.1 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.08 
 
 		 304 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  25.15 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 		 317 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6247  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 		 313 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.887249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.86 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  27.59 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  30.56 
 
 		 242 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  27.4 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0870  UspA domain protein  25.17 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  32.19 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  25.52 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  28.67 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  25.85 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  30.95 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  27.56 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  44 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8721  UspA domain protein  30.72 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0485057  normal  0.0484371 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  21.83 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  29.61 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  23.13 
 
 		 286 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  27.03 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  26.67 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  24.82 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0497  UspA domain protein  24.67 
 
 		 310 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  30.67 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  26.58 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03760  universal stress protein UspA-like protein  29.7 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00361063  normal  0.318246 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  27.15 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35.71 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  27.97 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  28.85 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  46.81 
 
 		 301 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  24.14 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  22.6 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  23.78 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  27.52 
 
 		 295 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.29 
 
 		 150 aa  44.7  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 128 aa  44.3  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 317 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0944  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  34.94 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  25.68 
 
 		 292 aa  43.9  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0528  UspA domain protein  28.66 
 
 		 145 aa  43.9  0.0009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.572687  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.19 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  23.23 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  25.49 
 
 		 320 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  35.71 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3700  hypothetical protein  31.65 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.66 
 
 		 305 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  51.35 
 
 		 309 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  24.14 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>