38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1329 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  621  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  49.67 
 
 		 307 aa  277  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  39.2 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  32.45 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  31.02 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  31.85 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  24.92 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0497  UspA domain protein  27.09 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 145 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1177  UspA domain protein  26.49 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  29.56 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  28.11 
 
 		 307 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  29.19 
 
 		 157 aa  54.3  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  23.6 
 
 		 288 aa  53.5  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1237  hypothetical protein  20.13 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.454178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  28.92 
 
 		 169 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  30.82 
 
 		 151 aa  49.7  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.03 
 
 		 145 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  29.7 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  30 
 
 		 141 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  28.29 
 
 		 141 aa  45.8  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  27.55 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  28.57 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  28.95 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  22.73 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  25.36 
 
 		 143 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  26.39 
 
 		 154 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 162 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0391  UspA domain-containing protein  30.52 
 
 		 142 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.308438 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  24.73 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2477  UspA domain-containing protein  28.7 
 
 		 159 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.65519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  23.6 
 
 		 317 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  24.32 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>