12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2477 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2477  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  323  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.65519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 		 314 aa  57.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  31.3 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  26.75 
 
 		 313 aa  51.2  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 310 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  25.95 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  25.49 
 
 		 292 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  23.72 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  26.57 
 
 		 310 aa  42.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  24.84 
 
 		 309 aa  41.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  34.62 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>