40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2062 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  100 
 
 		 163 aa  336  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  52.98 
 
 		 169 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  36.02 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  29.38 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  31.29 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  30.49 
 
 		 313 aa  70.9  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  32.52 
 
 		 323 aa  68.6  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  30.86 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 		 310 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  28.48 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  29.41 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  27.88 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 309 aa  57.4  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1177  UspA domain protein  30.99 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368824  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0048  hypothetical protein  27.81 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  25.3 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  29.56 
 
 		 307 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  24.68 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  24.71 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  25.15 
 
 		 310 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  32.56 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 318 aa  48.5  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2477  UspA domain-containing protein  25.95 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.65519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  24.85 
 
 		 145 aa  48.1  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  22.89 
 
 		 292 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  30.19 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  28.31 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  26.19 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  32.84 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  23.68 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3922  UspA domain protein  26.45 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  26.88 
 
 		 154 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  25.15 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  28.66 
 
 		 156 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  25.32 
 
 		 143 aa  42.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  26.88 
 
 		 154 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  25.31 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  41.18 
 
 		 300 aa  41.2  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0674  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>