79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1042 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 150 aa  303  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  36.02 
 
 		 163 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  36.97 
 
 		 169 aa  110  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  37.33 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 314 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 313 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 		 313 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 318 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  34.9 
 
 		 309 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 		 323 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1177  UspA domain protein  31.25 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368824  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  27.45 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  28.66 
 
 		 292 aa  61.6  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  27.88 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2477  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.65519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  27.56 
 
 		 310 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  33.12 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1945  UspA domain-containing protein  31.82 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  29.61 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2210  universal stress protein UspA  32.19 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  29.45 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  28.78 
 
 		 293 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  35.25 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 288 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  32.69 
 
 		 307 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  34.62 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  24.5 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  30.67 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  24.5 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  31.72 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3987  UspA domain protein  28.66 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  31.03 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  28.06 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 290 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  27.49 
 
 		 175 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4029  UspA domain protein  28.66 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  28.06 
 
 		 293 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0023  universal stress protein  23.24 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1803  UspA domain protein  31.94 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  24.5 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  27.7 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  25.83 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  30.86 
 
 		 320 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  23.84 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4568  hypothetical protein  30.63 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.77 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  31.58 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  25.83 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  32 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1659  UspA domain-containing protein  24.46 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  28 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  23.84 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  28.76 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  28.08 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.87 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  23.84 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.29 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  30.46 
 
 		 288 aa  41.2  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.19 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  23.84 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  23.84 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  23.84 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.22 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3816  UspA domain protein  28.4 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0222227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  28.21 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  30.52 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0071  UspA domain protein  24.68 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041598  normal  0.631556 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  35.59 
 
 		 296 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  25.83 
 
 		 315 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  28.86 
 
 		 145 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>