More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0071 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0071  UspA domain protein  100 
 
 		 156 aa  314  3e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.041598  normal  0.631556 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  37.27 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  30.2 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  30.2 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  32.45 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  31.61 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.32 
 
 		 304 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  32.69 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.2 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  29.45 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  26.47 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  28.21 
 
 		 295 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  30.06 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.07 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  25.95 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  30.77 
 
 		 187 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  28.93 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  27.92 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2379  UspA domain protein  28.48 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.54331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  29.75 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  29.87 
 
 		 275 aa  58.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  29.68 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  29.03 
 
 		 320 aa  57.8  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1780  universal stress protein  33.11 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.134073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  27.04 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  28.1 
 
 		 294 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  29.49 
 
 		 297 aa  57.4  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  31.13 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.95 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  25.48 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.48 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  28.57 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.95 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  30.92 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  27.71 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  28.29 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  26.58 
 
 		 515 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  26.42 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1890  putative universal stress protein, UspA-like  28.3 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  27.03 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.32 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  28.67 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3881  hypothetical protein  28.76 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3028  hypothetical protein  30.92 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0763744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.32 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.82 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  29.68 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.07 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.81 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  23.23 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  24.67 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  28.67 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  26.97 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0547  UspA domain protein  26.99 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.647041  normal  0.138657 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  26.97 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  25.62 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  24.53 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  30.67 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1578  UspA domain-containing protein  29.94 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.11 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  26.92 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  26.85 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  29.61 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  25.95 
 
 		 301 aa  53.9  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  26.97 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  28.1 
 
 		 276 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  28.93 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  27.11 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0260  universal stress protein  28.19 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  22.37 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28.66 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  26.8 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  26.85 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  26.25 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  24.52 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  29.11 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  44 
 
 		 290 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  27.33 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  23.65 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  25.47 
 
 		 283 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  30.95 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  29.41 
 
 		 287 aa  52.4  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  36.84 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3093  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.668919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3520  universal stress protein family  29.03 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0564413  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  29.33 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  29.33 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  24.7 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  24.2 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  27.33 
 
 		 297 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  29.33 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1650  UspA domain-containing protein  27.39 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.779795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>