More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2379 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2379  UspA domain protein  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.54331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  44.17 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0142  universal stress protein  33.96 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0115208  normal  0.579477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  33.96 
 
 		 142 aa  86.3  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  29.88 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  33.12 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  30.82 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  27.1 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  31.17 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  31.51 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  28.4 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  29.19 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  26.14 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  24.53 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  26.14 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  29.11 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  24.68 
 
 		 390 aa  58.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  25.31 
 
 		 306 aa  58.2  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  25.81 
 
 		 320 aa  57.8  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  26.35 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  28.57 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3574  UspA domain protein  25.9 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  26.45 
 
 		 149 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  26.92 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  29.94 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  27.27 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  44.64 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  28.3 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  23.9 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  27.95 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  23.75 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  28.48 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  26.58 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  27.1 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  29.19 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  27.04 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  32.61 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  26.11 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  26.58 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  34.18 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3585  UspA domain-containing protein  27.1 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.666006  normal  0.0498222 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_002936  DET1300  universal stress protein  29.11 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  25.95 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  24.2 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  26.62 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  24.2 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  26.92 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  25 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  26.92 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  28.12 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  25.62 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  26.45 
 
 		 325 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.73 
 
 		 300 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3202  UspA domain protein  24.69 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.805747  normal  0.0850987 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  26.09 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 317 aa  52.4  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  27.5 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  24.07 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1488  UspA domain protein  25 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.272512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  25.95 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3354  UspA domain-containing protein  26.92 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  32.5 
 
 		 297 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  23.78 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  35.9 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  26.11 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  22.22 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  35.9 
 
 		 151 aa  51.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  24.2 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  36.92 
 
 		 138 aa  51.2  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  30.49 
 
 		 145 aa  51.2  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  24.07 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  24.07 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  27.7 
 
 		 162 aa  50.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  24.07 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  24.07 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  27.16 
 
 		 148 aa  50.8  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0098  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  50.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0148787  normal  0.288023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.1 
 
 		 304 aa  50.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  26.45 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  42.62 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  36.92 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  26.28 
 
 		 277 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3808  UspA domain protein  24.22 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  44.44 
 
 		 325 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  26.11 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  24.52 
 
 		 515 aa  50.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  22.93 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  23.75 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  28.57 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  22.73 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  24.07 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  25.32 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  23.46 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.77 
 
 		 627 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  22.16 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>