105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1330 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1330  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  620  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1331  UspA domain-containing protein  49.84 
 
 		 303 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1329  UspA domain-containing protein  49.51 
 
 		 307 aa  277  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.457435  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0650  UspA domain-containing protein  41.19 
 
 		 323 aa  228  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1290  UspA domain-containing protein  39.29 
 
 		 313 aa  206  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.85216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0808  UspA domain-containing protein  36.39 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.188689  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1790  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 310 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238158  normal  0.669645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3245  UspA domain-containing protein  36.57 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3226  UspA domain-containing protein  32.57 
 
 		 313 aa  188  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1866  UspA domain-containing protein  26.52 
 
 		 310 aa  89.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1237  hypothetical protein  24.12 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.454178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0701  UspA domain protein  28.23 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1288  UspA domain protein  24.04 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.428871 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2777  hypothetical protein  32.21 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0181  UspA domain-containing protein  30.82 
 
 		 162 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.243572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2062  UspA domain protein  28.75 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0159  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2678  UspA domain-containing protein  24.52 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.159389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0497  UspA domain protein  25.1 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  25.57 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  27.45 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  27.45 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  29.26 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2375  UspA domain protein  29.07 
 
 		 169 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.561206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2228  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.424583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1042  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 150 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0801176  hitchhiker  0.000626372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0048  hypothetical protein  23.08 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2870  UspA domain-containing protein  24.92 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  22.04 
 
 		 287 aa  53.9  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  24.06 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4818  UspA domain protein  23.84 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0832286  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  31.85 
 
 		 139 aa  52.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0534  UspA domain protein  30.72 
 
 		 151 aa  52.8  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  29.73 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  27.46 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  26.45 
 
 		 145 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  27.17 
 
 		 278 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  30.92 
 
 		 140 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  26.09 
 
 		 273 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  27.1 
 
 		 140 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  25.62 
 
 		 154 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.66 
 
 		 288 aa  50.1  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 137 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  28.57 
 
 		 141 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  24.62 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1177  UspA domain protein  26.15 
 
 		 211 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.368824  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  22.83 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  29.41 
 
 		 140 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.52 
 
 		 290 aa  49.3  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 153 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 137 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  25.28 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0206  UspA domain-containing protein  27.21 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  23.31 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  23.47 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17970  universal stress protein family  28.1 
 
 		 142 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  22.34 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2827  hypothetical protein  26.43 
 
 		 275 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  24.18 
 
 		 291 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  29.8 
 
 		 151 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  29.8 
 
 		 151 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  26.39 
 
 		 140 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  25.32 
 
 		 147 aa  46.6  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  22.68 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2222  hypothetical protein  26.8 
 
 		 156 aa  46.2  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.544254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3847  UspA domain protein  29.37 
 
 		 145 aa  45.8  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000916772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  30.15 
 
 		 137 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2091  UspA domain-containing protein  30.71 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10254  normal  0.0585614 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  31.62 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  25.7 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03500  universal stress protein UspA-like protein  28.87 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.724222  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  25.69 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  27.13 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  27.03 
 
 		 150 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3411  hypothetical protein  25.57 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  27.46 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3474  UspA domain-containing protein  25.57 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408629  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  22.22 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3422  UspA domain-containing protein  25.57 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  32.97 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  26.12 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  27.03 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  23.15 
 
 		 390 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  27.64 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4144  UspA domain protein  26.96 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0436  hypothetical protein  32.26 
 
 		 802 aa  44.3  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4155  UspA domain-containing protein  30.12 
 
 		 176 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  24.62 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  27.27 
 
 		 187 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  27.72 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  21.81 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.69 
 
 		 180 aa  43.5  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.04 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  47.5 
 
 		 142 aa  43.1  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  27.88 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2086  UspA domain protein  27.22 
 
 		 153 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  23.61 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>